在《三体》这部科幻小说中，叶文洁背叛人类的原因是多方面的。首先，是对浩劫深刻的失望。在那个动荡的人类社会里，她亲眼目睹了父亲叶哲泰被打死，以及母亲邵琳因揭露真相而与父亲离婚和斗死，这些经历让年轻的心灵受到极大的创伤。她对人性的丧失感到恐惧，对人性的失望心灰意冷。

其次，是被出卖的痛苦经历。当她在内蒙古生产建设兵团务农时，记者白沐霖帮助她重新发出给中央写信的事宜，但后来因为白沐霖出卖她，叶文洁成为了替罪羊。这一切都让她的信任感受到了严重打击。

再者，在红岸基地期间，她遭到雷政委的欺骗，他想独占她的研究成果，而当她试图找到那些曾经欺负过她的人们时，他们毫无悔意甚至不愿道歉，这些经历使得叶文洁更加绝望。

最后，当她发现发射器可以用太阳作为巨大的放大器向外星球发送信息时，她开始思考解决人类问题的一种方式。她觉得如果能够引起外星人的关注，让他们改变地球人的行为，那么或许能避免更多悲剧发生。因此，她毫不犹豫地向宇宙发出了信号，最终导致三体舰队对地球进行了定位，从而开启了一场毁灭性的侵略行动。