在《三体》这部科幻巨作中，叶文洁背叛人类的原因是多方面的。首先，她对浩劫时期的人性失望。她的父亲、物理学家叶哲泰被小将用皮带抽打，这让年轻的心灵受到了极大的创伤。而母亲邵琳又被安排揭发了叶文洁的父亲，导致家庭破裂，父亲在批斗会上惨死。这一切人性的丧失让她对同类产生了深深的恐惧，对人性的失望让她心灰意冷。

其次，被人出卖加剧了她的绝望。在内蒙古生产建设兵团务农期间，记者白沐霖借给她一本《寂静的春天》，书中提出了人类无法自我约束，只能依靠外部力量这一观点，这种思想在她的心中生根发芽。她帮助白沐霖重新抄写并发出信件，但最终因为白沐霖出卖，她成为了替罪羊。

再者，在红岸基地工作时，雷政委不仅欺骗了她，还想独占她的研究成果。之后，当她寻找曾经与父亲生活过的人，却发现那些人的态度毫无悔意，即使面对过去所做错事，也没有道歉之意。这一次又一次的失望，让叶文洁彻底放弃了对人类社会的希望。

最后，在红岸基地偶然发现地球利用太阳作为巨型发射器向外星球发送信息的事实后，她回顾了一系列不幸和悲哀觉得解决问题唯一办法就是引入外星力量来改变人类。于是，不犹豫地向宇宙发出信号，使得三体星球执政官准确定位地球，最终决定发动侵略。这一切都源于叶文洁的心理阴影和对人类未来绝望的情绪。