在《三体》这部科幻巨作中，叶文洁背叛人类的原因是多方面的。首先，她对浩劫时期的人性失望。她的父亲、物理学家叶哲泰被小将用皮带抽打，这让年轻的心灵受到了极大的创伤。而母亲邵琳后来揭发了父亲的“罪行”，导致家庭破裂，父亲在批斗会上惨死，这些经历让她对人性的丧失感到深深恐惧，对人性的光辉感到绝望。

其次，她被人出卖，让她对人性更加失望透顶。在内蒙古生产建设兵团务农期间，被记者白沐霖借给的一本书《寂静的春天》影响了她的观念。这本书表达了人类无法自我道德约束，需要外部力量支持的思想，这种思想在她心中播下了一颗种子。当白沐霖出卖了她，而部主任调查时，她成为了替罪羊，这样的经历让她的信任和希望彻底崩溃。

再者，当叶文洁进入红岸基地后，雷政委一直欺骗并试图夺走她的研究成果。她发现自己处于一个无力改变命运的小人物地位，遭遇连续不断的人生挫折，每一次都是对人类道德和正义所持有的幻想与期待的彻底摧毁。

最后，在红岸基地偶然间发现地球利用太阳作为发射器向外星球发送信号的事实，让她意识到地球人的悲哀与无助。她觉得唯一能改变这一切的是外星人的介入，因此毫不犹豫地向宇宙发出信号，使得三体星球执政官准确定位地球，并决定进行侵略。