在《三体》这部科幻巨作中，叶文洁背叛人类的原因是多方面的。首先，她对浩劫时期的人性失望。她的父亲、物理学家叶哲泰被小将用皮带抽打，这让年轻的心灵受到了极大的创伤。而母亲邵琳后来揭发了父亲的“罪行”，导致家庭破裂，父亲在批斗会上惨死，这些经历让她对人性的丧失感到深深恐惧，对人性的失望心灰意冷。

其次，她被人出卖，让她对人性更加失望透顶。在内蒙古生产建设兵团务农期间，被记者白沐霖借给的一本书《寂静的春天》影响了她的观念。这本书提出了一个观点：人类无法自我道德约束，需要外部力量引导。这也为她心中的种子埋下了一颗种子。

之后，在林场调查时，由于白沐霖的出卖，她成了替罪羊。这些经历都加剧了她的对人类社会和个人关系的绝望感。

当叶文洁进入红岸基地后，又一次遭遇欺骗。一位名叫雷政委的人想要独占她的研究成果，而不是真正帮助或尊重她。她还尝试联系曾帮助过父亲的人，但那些人的态度让她再次感到绝望——他们毫无悔意，不仅不道歉，还要与她断绝关系。

最后，当她偶然发现红岸基地实际使用太阳作为巨型发射器，可以放大信号并向外星传送时，她回忆起所有往事，包括自己的不幸以及人类悲哀。她认为解决办法就是让外星力量改变人类，因此毫不犹豫地向宇宙发出信号，使得三体星球执政官准确定位地球，并决定发动侵略。这一切都是由叶文洁内心深处对于救赎和希望所驱使。